Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB1P16220 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB1P16220 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB1P16220 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB1P16220 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB1P16220 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB1P16220 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB1P16220 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB1P16220 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB1P16220 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB1P16220 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB1P16220 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB1P16220 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB1P16220 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB1P16220 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB1P16220 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB1P16220 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB1P16220 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB1P16220 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB1P16220 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB1P16220 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB1P16220 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB1P16220 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB1P16220 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB1P16220 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB1P16220 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB1P16220 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB1P16220 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB1P16220 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB1P16220 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB1P16220 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB1P16220 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB1P16220 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB1P16220 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB1P16220 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CREB1P16220 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CREB1P16220 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CREB1P16220 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CREB1P16220 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CREB1P16220 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CREB1P16220 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CREB1P16220 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CREB1P16220 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB1P16220 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB1P16220 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB1P16220 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB1P16220 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB1P16220 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB1P16220 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB1P16220 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB1P16220 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB1P16220 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB1P16220 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB1P16220 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB1P16220 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB1P16220 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB1P16220 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB1P16220 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB1P16220 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB1P16220 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB1P16220 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB1P16220 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB1P16220 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB1P16220 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB1P16220 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB1P16220 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB1P16220 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB1P16220 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB1P16220 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB1P16220 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB1P16220 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB1P16220 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB1P16220 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB1P16220 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB1P16220 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB1P16220 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CREB1P16220 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CREB1P16220 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CREB1P16220 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CREB1P16220 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB1P16220 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB1P16220 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB1P16220 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB1P16220 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB1P16220 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB1P16220 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB1P16220 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB1P16220 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB1P16220 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB1P16220 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB1P16220 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB1P16220 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB1P16220 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB1P16220 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB1P16220 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB1P16220 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB1P16220 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB1P16220 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB1P16220 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB1P16220 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms