Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME1P15531 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NME1P15531 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NME1P15531 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NME1P15531 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NME1P15531 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NME1P15531 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NME1P15531 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NME1P15531 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NME1P15531 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME1P15531 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME1P15531 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME1P15531 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME1P15531 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME1P15531 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME1P15531 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME1P15531 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME1P15531 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME1P15531 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NME1P15531 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME1P15531 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME1P15531 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME1P15531 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME1P15531 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NME1P15531 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NME1P15531 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME1P15531 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME1P15531 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME1P15531 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME1P15531 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME1P15531 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME1P15531 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME1P15531 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME1P15531 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME1P15531 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME1P15531 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NME1P15531 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME1P15531 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME1P15531 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME1P15531 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME1P15531 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME1P15531 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME1P15531 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME1P15531 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME1P15531 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NME1P15531 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME1P15531 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NME1P15531 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME1P15531 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME1P15531 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME1P15531 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME1P15531 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME1P15531 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME1P15531 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME1P15531 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NME1P15531 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME1P15531 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME1P15531 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NME1P15531 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME1P15531 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME1P15531 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME1P15531 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME1P15531 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NME1P15531 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME1P15531 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME1P15531 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME1P15531 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME1P15531 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NME1P15531 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NME1P15531 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NME1P15531 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NME1P15531 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME1P15531 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NME1P15531 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NME1P15531 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME1P15531 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME1P15531 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME1P15531 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME1P15531 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME1P15531 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NME1P15531 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME1P15531 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME1P15531 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NME1P15531 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME1P15531 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME1P15531 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME1P15531 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME1P15531 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NME1P15531 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME1P15531 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME1P15531 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NME1P15531 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME1P15531 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME1P15531 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME1P15531 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME1P15531 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME1P15531 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME1P15531 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME1P15531 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME1P15531 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms