Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNRPBP14678 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPBP14678 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms