Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms