Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB1P12018 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB1P12018 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VPREB1P12018 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB1P12018 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB1P12018 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB1P12018 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB1P12018 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB1P12018 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB1P12018 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB1P12018 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB1P12018 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB1P12018 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB1P12018 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB1P12018 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB1P12018 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB1P12018 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB1P12018 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB1P12018 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB1P12018 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB1P12018 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VPREB1P12018 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms