Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC1P11940 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms