Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TNP1P09430 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TNP1P09430 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TNP1P09430 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TNP1P09430 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TNP1P09430 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TNP1P09430 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TNP1P09430 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TNP1P09430 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TNP1P09430 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TNP1P09430 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TNP1P09430 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TNP1P09430 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TNP1P09430 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TNP1P09430 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TNP1P09430 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TNP1P09430 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TNP1P09430 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TNP1P09430 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TNP1P09430 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TNP1P09430 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TNP1P09430 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TNP1P09430 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TNP1P09430 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TNP1P09430 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TNP1P09430 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TNP1P09430 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TNP1P09430 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TNP1P09430 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TNP1P09430 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
TNP1P09430 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TNP1P09430 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TNP1P09430 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TNP1P09430 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TNP1P09430 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TNP1P09430 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TNP1P09430 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
TNP1P09430 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TNP1P09430 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TNP1P09430 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TNP1P09430 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TNP1P09430 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TNP1P09430 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TNP1P09430 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TNP1P09430 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TNP1P09430 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TNP1P09430 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TNP1P09430 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TNP1P09430 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TNP1P09430 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TNP1P09430 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TNP1P09430 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TNP1P09430 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TNP1P09430 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TNP1P09430 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TNP1P09430 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TNP1P09430 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TNP1P09430 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TNP1P09430 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TNP1P09430 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TNP1P09430 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TNP1P09430 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TNP1P09430 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TNP1P09430 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
TNP1P09430 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TNP1P09430 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TNP1P09430 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TNP1P09430 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TNP1P09430 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TNP1P09430 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TNP1P09430 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TNP1P09430 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TNP1P09430 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TNP1P09430 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TNP1P09430 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TNP1P09430 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TNP1P09430 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TNP1P09430 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TNP1P09430 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TNP1P09430 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TNP1P09430 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TNP1P09430 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TNP1P09430 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TNP1P09430 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TNP1P09430 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TNP1P09430 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TNP1P09430 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TNP1P09430 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TNP1P09430 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TNP1P09430 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TNP1P09430 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TNP1P09430 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TNP1P09430 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TNP1P09430 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TNP1P09430 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TNP1P09430 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TNP1P09430 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TNP1P09430 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TNP1P09430 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TNP1P09430 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms