Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VIL1P09327 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VIL1P09327 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VIL1P09327 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VIL1P09327 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VIL1P09327 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VIL1P09327 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VIL1P09327 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
VIL1P09327 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VIL1P09327 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VIL1P09327 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VIL1P09327 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VIL1P09327 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VIL1P09327 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VIL1P09327 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VIL1P09327 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VIL1P09327 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VIL1P09327 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
VIL1P09327 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VIL1P09327 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VIL1P09327 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VIL1P09327 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VIL1P09327 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VIL1P09327 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VIL1P09327 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VIL1P09327 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VIL1P09327 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VIL1P09327 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VIL1P09327 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VIL1P09327 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VIL1P09327 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VIL1P09327 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VIL1P09327 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VIL1P09327 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VIL1P09327 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VIL1P09327 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VIL1P09327 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
VIL1P09327 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VIL1P09327 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VIL1P09327 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VIL1P09327 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VIL1P09327 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VIL1P09327 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VIL1P09327 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VIL1P09327 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VIL1P09327 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VIL1P09327 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VIL1P09327 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VIL1P09327 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VIL1P09327 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VIL1P09327 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VIL1P09327 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VIL1P09327 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VIL1P09327 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VIL1P09327 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VIL1P09327 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VIL1P09327 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VIL1P09327 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VIL1P09327 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VIL1P09327 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VIL1P09327 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VIL1P09327 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VIL1P09327 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VIL1P09327 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VIL1P09327 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VIL1P09327 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VIL1P09327 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VIL1P09327 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VIL1P09327 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VIL1P09327 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VIL1P09327 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VIL1P09327 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
VIL1P09327 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VIL1P09327 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VIL1P09327 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VIL1P09327 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VIL1P09327 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VIL1P09327 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VIL1P09327 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VIL1P09327 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VIL1P09327 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VIL1P09327 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VIL1P09327 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VIL1P09327 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
VIL1P09327 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VIL1P09327 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VIL1P09327 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VIL1P09327 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VIL1P09327 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VIL1P09327 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VIL1P09327 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
VIL1P09327 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VIL1P09327 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VIL1P09327 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VIL1P09327 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VIL1P09327 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VIL1P09327 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VIL1P09327 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VIL1P09327 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VIL1P09327 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms