Protein–RNA interactions for Protein: P04844

RPN2, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN2P04844 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPN2P04844 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPN2P04844 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPN2P04844 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPN2P04844 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPN2P04844 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPN2P04844 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RPN2P04844 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPN2P04844 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPN2P04844 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPN2P04844 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPN2P04844 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPN2P04844 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPN2P04844 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPN2P04844 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPN2P04844 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPN2P04844 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN2P04844 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN2P04844 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN2P04844 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN2P04844 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN2P04844 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN2P04844 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN2P04844 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN2P04844 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPN2P04844 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPN2P04844 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPN2P04844 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPN2P04844 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPN2P04844 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPN2P04844 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPN2P04844 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPN2P04844 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPN2P04844 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPN2P04844 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPN2P04844 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPN2P04844 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPN2P04844 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPN2P04844 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPN2P04844 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPN2P04844 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RPN2P04844 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPN2P04844 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPN2P04844 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPN2P04844 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPN2P04844 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPN2P04844 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPN2P04844 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPN2P04844 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPN2P04844 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPN2P04844 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPN2P04844 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPN2P04844 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPN2P04844 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPN2P04844 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPN2P04844 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPN2P04844 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPN2P04844 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPN2P04844 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPN2P04844 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPN2P04844 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPN2P04844 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPN2P04844 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPN2P04844 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPN2P04844 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPN2P04844 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPN2P04844 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPN2P04844 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPN2P04844 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPN2P04844 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPN2P04844 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPN2P04844 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPN2P04844 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPN2P04844 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPN2P04844 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPN2P04844 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPN2P04844 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPN2P04844 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPN2P04844 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPN2P04844 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPN2P04844 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPN2P04844 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPN2P04844 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPN2P04844 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPN2P04844 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPN2P04844 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPN2P04844 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPN2P04844 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPN2P04844 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPN2P04844 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPN2P04844 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPN2P04844 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPN2P04844 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPN2P04844 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPN2P04844 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPN2P04844 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPN2P04844 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPN2P04844 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPN2P04844 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPN2P04844 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms