Protein–RNA interactions for Protein: P00395

MT-CO1, Cytochrome c oxidase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-CO1P00395 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MT-CO1P00395 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MT-CO1P00395 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MT-CO1P00395 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
MT-CO1P00395 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MT-CO1P00395 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MT-CO1P00395 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MT-CO1P00395 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MT-CO1P00395 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MT-CO1P00395 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MT-CO1P00395 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MT-CO1P00395 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MT-CO1P00395 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MT-CO1P00395 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MT-CO1P00395 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MT-CO1P00395 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MT-CO1P00395 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MT-CO1P00395 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MT-CO1P00395 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MT-CO1P00395 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MT-CO1P00395 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MT-CO1P00395 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MT-CO1P00395 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MT-CO1P00395 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MT-CO1P00395 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MT-CO1P00395 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MT-CO1P00395 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms