Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN7O95471 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.1 ms