Protein–RNA interactions for Protein: O75865

TRAPPC6A, Trafficking protein particle complex subunit 6A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6AO75865 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC6AO75865 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms