Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.753e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.743e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ADAMTSL5-204ENST00000585804 574 ntTSL 419.66■□□□□ 0.743e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.733e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.733e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.733e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 VWA1-202ENST00000471398 458 ntTSL 319.58■□□□□ 0.733e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 COPRS-204ENST00000579741 471 ntTSL 319.57■□□□□ 0.721e-11■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.721e-11■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CDC42EP1-203ENST00000430687 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.55■□□□□ 0.722e-17■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ATG16L2-206ENST00000535830 963 ntTSL 219.55■□□□□ 0.723e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.723e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.712e-6■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PSD4-202ENST00000409378 580 ntTSL 319.51■□□□□ 0.713e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.713e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CTSH-210ENST00000529861 857 ntTSL 319.4■□□□□ 0.73e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 GORASP2-205ENST00000455067 530 ntTSL 419.38■□□□□ 0.693e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.693e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 LRRC45-205ENST00000583302 1289 ntTSL 219.32■□□□□ 0.683e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 GAS6-204ENST00000608763 2646 nt19.32■□□□□ 0.683e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.683e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SPIDR-207ENST00000518692 726 ntTSL 519.24■□□□□ 0.673e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ADAMTSL5-209ENST00000590562 573 ntTSL 419.23■□□□□ 0.673e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 INPP5A-206ENST00000487614 870 ntTSL 519.22■□□□□ 0.673e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.663e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 GORASP2-204ENST00000454751 624 ntTSL 519.12■□□□□ 0.653e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 GORASP2-210ENST00000497674 563 ntTSL 219.1■□□□□ 0.653e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.653e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.643e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.633e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MYO1D-204ENST00000577352 1008 ntTSL 218.97■□□□□ 0.631e-11■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 POLD2-212ENST00000467469 528 ntTSL 318.97■□□□□ 0.633e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 NTRK1-205ENST00000497019 2508 ntTSL 218.95■□□□□ 0.623e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 USP39-208ENST00000455732 623 ntTSL 318.91■□□□□ 0.623e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.613e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ATG16L2-217ENST00000541999 537 ntTSL 318.86■□□□□ 0.613e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.63e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MYO18A-203ENST00000528322 549 ntTSL 418.77■□□□□ 0.63e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.593e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.583e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.583e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PRKCZ-205ENST00000461465 480 ntTSL 418.65■□□□□ 0.583e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CLN3-211ENST00000564091 790 ntTSL 518.64■□□□□ 0.573e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.573e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ZFAND2A-206ENST00000484977 1084 ntTSL 218.62■□□□□ 0.573e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.573e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MAEA-216ENST00000512308 839 ntTSL 518.58■□□□□ 0.572e-17■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SLCO3A1-209ENST00000555769 1850 ntTSL 1 (best)18.57■□□□□ 0.563e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PRKAR1B-207ENST00000430040 1006 ntTSL 318.55■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MUS81-208ENST00000529742 733 ntTSL 218.55■□□□□ 0.563e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.563e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 NPEPPS-220ENST00000533573 559 ntTSL 418.5■□□□□ 0.553e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.553e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ZNF205-203ENST00000414351 1006 ntTSL 318.39■□□□□ 0.533e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MYBBP1A-203ENST00000570986 982 ntTSL 218.39■□□□□ 0.533e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ZNF571-AS1-206ENST00000589750 515 ntTSL 318.38■□□□□ 0.533e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 USP39-211ENST00000465282 568 ntTSL 418.35■□□□□ 0.533e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 GORASP2-203ENST00000444801 568 ntTSL 318.35■□□□□ 0.533e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.523e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MAEA-203ENST00000502558 570 ntTSL 218.32■□□□□ 0.522e-17■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CELF5-202ENST00000334293 1591 ntTSL 218.3■□□□□ 0.523e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MAEA-218ENST00000513301 595 ntTSL 418.23■□□□□ 0.512e-17■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SOCS7-203ENST00000617360 2051 ntTSL 518.21■□□□□ 0.53e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.53e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.53e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 TBC1D31-209ENST00000520368 653 ntTSL 418.14■□□□□ 0.493e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.493e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.483e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CTSH-213ENST00000533777 2101 ntTSL 1 (best)18.03■□□□□ 0.483e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ZNF571-AS1-210ENST00000591430 722 ntTSL 318.02■□□□□ 0.483e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ZNF571-AS1-202ENST00000586013 477 ntTSL 1 (best)18■□□□□ 0.473e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ABCA2-216ENST00000476211 997 ntTSL 217.98■□□□□ 0.473e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PRKAR1B-205ENST00000414568 752 ntTSL 517.98■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PRKCZ-204ENST00000461106 1916 ntTSL 217.88■□□□□ 0.453e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.453e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CTDSPL-204ENST00000435525 371 ntTSL 317.83■□□□□ 0.443e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ZC3H7A-208ENST00000572781 564 ntTSL 417.81■□□□□ 0.443e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 C15orf39-203ENST00000562637 532 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.81■□□□□ 0.443e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 TBC1D31-203ENST00000518099 1159 ntTSL 1 (best)17.77■□□□□ 0.443e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 LIN37-209ENST00000595455 1635 ntTSL 517.74■□□□□ 0.433e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.423e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.423e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ST6GALNAC4-207ENST00000495983 1362 ntTSL 517.64■□□□□ 0.413e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.413e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MAEA-211ENST00000509254 598 ntTSL 417.62■□□□□ 0.412e-17■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.43e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.43e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.393e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PSD4-203ENST00000409656 2394 ntTSL 217.5■□□□□ 0.393e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.393e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.393e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 GNA11-203ENST00000586763 354 ntTSL 317.43■□□□□ 0.383e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ST6GALNAC4-203ENST00000467674 812 ntTSL 217.41■□□□□ 0.383e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.383e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 DPF3-212ENST00000556902 550 ntTSL 417.38■□□□□ 0.373e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SLC9A3R2-207ENST00000565855 759 ntTSL 217.38■□□□□ 0.371e-11■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.36■□□□□ 0.373e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 USP39-205ENST00000442708 561 ntTSL 417.33■□□□□ 0.363e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.363e-9■■■■■ 206.8
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 529.4 ms