Protein–RNA interactions for Protein: O60341

KDM1A, Lysine-specific histone demethylase 1A, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1AO60341 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM1AO60341 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms