Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUX1O43812 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUX1O43812 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUX1O43812 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUX1O43812 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUX1O43812 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUX1O43812 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUX1O43812 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUX1O43812 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUX1O43812 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUX1O43812 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUX1O43812 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUX1O43812 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUX1O43812 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUX1O43812 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUX1O43812 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUX1O43812 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUX1O43812 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUX1O43812 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUX1O43812 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUX1O43812 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DUX1O43812 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUX1O43812 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUX1O43812 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUX1O43812 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUX1O43812 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DUX1O43812 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUX1O43812 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUX1O43812 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUX1O43812 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUX1O43812 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DUX1O43812 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUX1O43812 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUX1O43812 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUX1O43812 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUX1O43812 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUX1O43812 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUX1O43812 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUX1O43812 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUX1O43812 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUX1O43812 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DUX1O43812 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUX1O43812 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUX1O43812 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUX1O43812 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUX1O43812 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUX1O43812 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUX1O43812 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUX1O43812 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUX1O43812 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUX1O43812 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUX1O43812 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUX1O43812 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DUX1O43812 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUX1O43812 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUX1O43812 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUX1O43812 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUX1O43812 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUX1O43812 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUX1O43812 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUX1O43812 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUX1O43812 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUX1O43812 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUX1O43812 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUX1O43812 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUX1O43812 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUX1O43812 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUX1O43812 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUX1O43812 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUX1O43812 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUX1O43812 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUX1O43812 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DUX1O43812 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUX1O43812 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUX1O43812 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUX1O43812 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUX1O43812 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUX1O43812 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUX1O43812 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUX1O43812 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUX1O43812 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUX1O43812 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DUX1O43812 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUX1O43812 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUX1O43812 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUX1O43812 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUX1O43812 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUX1O43812 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUX1O43812 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DUX1O43812 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUX1O43812 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUX1O43812 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUX1O43812 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUX1O43812 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUX1O43812 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUX1O43812 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUX1O43812 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUX1O43812 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUX1O43812 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DUX1O43812 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms