Protein–RNA interactions for Protein: O15540

FABP7, Fatty acid-binding protein, brain, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FABP7O15540 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FABP7O15540 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FABP7O15540 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FABP7O15540 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FABP7O15540 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FABP7O15540 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FABP7O15540 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FABP7O15540 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FABP7O15540 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FABP7O15540 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FABP7O15540 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FABP7O15540 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FABP7O15540 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FABP7O15540 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FABP7O15540 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FABP7O15540 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FABP7O15540 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FABP7O15540 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FABP7O15540 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FABP7O15540 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FABP7O15540 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FABP7O15540 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FABP7O15540 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FABP7O15540 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FABP7O15540 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FABP7O15540 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FABP7O15540 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FABP7O15540 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FABP7O15540 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FABP7O15540 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FABP7O15540 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FABP7O15540 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FABP7O15540 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FABP7O15540 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FABP7O15540 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FABP7O15540 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FABP7O15540 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FABP7O15540 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FABP7O15540 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FABP7O15540 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FABP7O15540 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FABP7O15540 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FABP7O15540 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FABP7O15540 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FABP7O15540 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FABP7O15540 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FABP7O15540 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FABP7O15540 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FABP7O15540 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FABP7O15540 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FABP7O15540 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FABP7O15540 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FABP7O15540 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FABP7O15540 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FABP7O15540 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FABP7O15540 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FABP7O15540 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FABP7O15540 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FABP7O15540 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FABP7O15540 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FABP7O15540 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FABP7O15540 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FABP7O15540 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FABP7O15540 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FABP7O15540 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FABP7O15540 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FABP7O15540 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FABP7O15540 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FABP7O15540 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FABP7O15540 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FABP7O15540 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FABP7O15540 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FABP7O15540 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FABP7O15540 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FABP7O15540 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FABP7O15540 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FABP7O15540 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FABP7O15540 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FABP7O15540 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FABP7O15540 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FABP7O15540 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FABP7O15540 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FABP7O15540 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FABP7O15540 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FABP7O15540 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FABP7O15540 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FABP7O15540 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FABP7O15540 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FABP7O15540 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FABP7O15540 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FABP7O15540 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FABP7O15540 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FABP7O15540 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FABP7O15540 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FABP7O15540 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FABP7O15540 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FABP7O15540 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FABP7O15540 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FABP7O15540 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FABP7O15540 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms