Protein–RNA interactions for Protein: I3L0E3

hCG_1984214, HCG1984214, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
hCG_1984214I3L0E3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
hCG_1984214I3L0E3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
hCG_1984214I3L0E3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
hCG_1984214I3L0E3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
hCG_1984214I3L0E3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
hCG_1984214I3L0E3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
hCG_1984214I3L0E3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
hCG_1984214I3L0E3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
hCG_1984214I3L0E3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
hCG_1984214I3L0E3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
hCG_1984214I3L0E3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
hCG_1984214I3L0E3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
hCG_1984214I3L0E3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
hCG_1984214I3L0E3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
hCG_1984214I3L0E3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
hCG_1984214I3L0E3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
hCG_1984214I3L0E3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
hCG_1984214I3L0E3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
hCG_1984214I3L0E3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
hCG_1984214I3L0E3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
hCG_1984214I3L0E3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
hCG_1984214I3L0E3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
hCG_1984214I3L0E3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
hCG_1984214I3L0E3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
hCG_1984214I3L0E3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms