Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC188H7C350 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms