Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF3BA8MYP8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF3BA8MYP8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF3BA8MYP8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF3BA8MYP8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF3BA8MYP8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF3BA8MYP8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF3BA8MYP8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF3BA8MYP8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF3BA8MYP8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF3BA8MYP8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF3BA8MYP8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF3BA8MYP8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF3BA8MYP8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF3BA8MYP8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF3BA8MYP8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF3BA8MYP8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF3BA8MYP8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF3BA8MYP8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF3BA8MYP8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODF3BA8MYP8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 294.8 ms