Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYSRT1A8MQ03 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYSRT1A8MQ03 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms