Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
ARID3CA6NKF2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ARID3CA6NKF2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
ARID3CA6NKF2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
ARID3CA6NKF2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
ARID3CA6NKF2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ARID3CA6NKF2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ARID3CA6NKF2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
ARID3CA6NKF2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ARID3CA6NKF2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ARID3CA6NKF2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ARID3CA6NKF2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ARID3CA6NKF2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ARID3CA6NKF2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ARID3CA6NKF2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ARID3CA6NKF2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
ARID3CA6NKF2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ARID3CA6NKF2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ARID3CA6NKF2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
ARID3CA6NKF2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
ARID3CA6NKF2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
ARID3CA6NKF2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
ARID3CA6NKF2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
ARID3CA6NKF2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
ARID3CA6NKF2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ARID3CA6NKF2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ARID3CA6NKF2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ARID3CA6NKF2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ARID3CA6NKF2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ARID3CA6NKF2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ARID3CA6NKF2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ARID3CA6NKF2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ARID3CA6NKF2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ARID3CA6NKF2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ARID3CA6NKF2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ARID3CA6NKF2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ARID3CA6NKF2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
ARID3CA6NKF2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ARID3CA6NKF2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
ARID3CA6NKF2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
ARID3CA6NKF2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
ARID3CA6NKF2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
ARID3CA6NKF2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ARID3CA6NKF2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ARID3CA6NKF2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ARID3CA6NKF2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
ARID3CA6NKF2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ARID3CA6NKF2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ARID3CA6NKF2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
ARID3CA6NKF2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ARID3CA6NKF2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ARID3CA6NKF2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ARID3CA6NKF2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ARID3CA6NKF2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
ARID3CA6NKF2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ARID3CA6NKF2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ARID3CA6NKF2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ARID3CA6NKF2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ARID3CA6NKF2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ARID3CA6NKF2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ARID3CA6NKF2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ARID3CA6NKF2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ARID3CA6NKF2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ARID3CA6NKF2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ARID3CA6NKF2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
ARID3CA6NKF2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ARID3CA6NKF2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
ARID3CA6NKF2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ARID3CA6NKF2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ARID3CA6NKF2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms