Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU0

FAM187A, Ig-like V-type domain-containing protein FAM187A, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187AA6NFU0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM187AA6NFU0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM187AA6NFU0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM187AA6NFU0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM187AA6NFU0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM187AA6NFU0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM187AA6NFU0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM187AA6NFU0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM187AA6NFU0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM187AA6NFU0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM187AA6NFU0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM187AA6NFU0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM187AA6NFU0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM187AA6NFU0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM187AA6NFU0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM187AA6NFU0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM187AA6NFU0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM187AA6NFU0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM187AA6NFU0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM187AA6NFU0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM187AA6NFU0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 384.6 ms