Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA6L4A6NEF3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms