Protein–RNA interactions for Protein: A4QN01

LINC01553, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01553, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01553A4QN01 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC01553A4QN01 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LINC01553A4QN01 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC01553A4QN01 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC01553A4QN01 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms