Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRGMA1A4Y4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms