Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXY3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXY3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0J9YXY3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0J9YXY3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0J9YXY3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0J9YXY3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0J9YXY3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0J9YXY3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0J9YXY3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXY3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YXY3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YXY3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YXY3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YXY3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YXY3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YXY3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YXY3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YXY3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YXY3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YXY3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YXY3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YXY3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YXY3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YXY3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YXY3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YXY3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YXY3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YXY3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YXY3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YXY3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YXY3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YXY3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YXY3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms