Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
V9GYQ6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
V9GYQ6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
V9GYQ6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
V9GYQ6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
V9GYQ6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
V9GYQ6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
V9GYQ6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
V9GYQ6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
V9GYQ6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
V9GYQ6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
V9GYQ6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
V9GYQ6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
V9GYQ6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
V9GYQ6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
V9GYQ6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
V9GYQ6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
V9GYQ6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
V9GYQ6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
V9GYQ6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYQ6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYQ6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYQ6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYQ6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYQ6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYQ6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYQ6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYQ6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYQ6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYQ6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYQ6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYQ6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYQ6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYQ6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYQ6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYQ6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYQ6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYQ6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYQ6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
V9GYQ6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
V9GYQ6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
V9GYQ6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
V9GYQ6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
V9GYQ6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
V9GYQ6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
V9GYQ6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
V9GYQ6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
V9GYQ6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
V9GYQ6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
V9GYQ6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
V9GYQ6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
V9GYQ6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
V9GYQ6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
V9GYQ6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
V9GYQ6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
V9GYQ6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
V9GYQ6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
V9GYQ6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
V9GYQ6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
V9GYQ6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
V9GYQ6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
V9GYQ6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
V9GYQ6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
V9GYQ6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
V9GYQ6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
V9GYQ6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
V9GYQ6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
V9GYQ6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
V9GYQ6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
V9GYQ6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
V9GYQ6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
V9GYQ6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
V9GYQ6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
V9GYQ6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
V9GYQ6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
V9GYQ6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
V9GYQ6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
V9GYQ6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
V9GYQ6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
V9GYQ6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
V9GYQ6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
V9GYQ6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
V9GYQ6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
V9GYQ6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
V9GYQ6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
V9GYQ6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
V9GYQ6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
V9GYQ6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
V9GYQ6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
V9GYQ6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
V9GYQ6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
V9GYQ6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
V9GYQ6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
V9GYQ6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
V9GYQ6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
V9GYQ6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
V9GYQ6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
V9GYQ6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
V9GYQ6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
V9GYQ6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms