Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
AUP1Q9Y679 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
AUP1Q9Y679 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms