Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PAXBP1Q9Y5B6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms