Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP15Q9Y4E8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms