Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTX4Q9Y2E6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms