Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SMC3Q9UQE7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMC3Q9UQE7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms