Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC13A4Q9UKG4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms