Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC23Q9UJX2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC23Q9UJX2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms