Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18L2Q9UHA2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms