Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSFQ9UBX1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms