Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DKK3Q9UBP4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DKK3Q9UBP4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms