Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CACNG4Q9UBN1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms