Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E3

ZNFX1, NFX1-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNFX1Q9P2E3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNFX1Q9P2E3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNFX1Q9P2E3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms