Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD3Q9NX63 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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