Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SDHAF2Q9NX18 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDHAF2Q9NX18 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDHAF2Q9NX18 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDHAF2Q9NX18 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDHAF2Q9NX18 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDHAF2Q9NX18 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDHAF2Q9NX18 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDHAF2Q9NX18 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDHAF2Q9NX18 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDHAF2Q9NX18 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDHAF2Q9NX18 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDHAF2Q9NX18 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDHAF2Q9NX18 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SDHAF2Q9NX18 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDHAF2Q9NX18 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SDHAF2Q9NX18 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDHAF2Q9NX18 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDHAF2Q9NX18 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SDHAF2Q9NX18 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SDHAF2Q9NX18 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SDHAF2Q9NX18 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SDHAF2Q9NX18 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SDHAF2Q9NX18 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDHAF2Q9NX18 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDHAF2Q9NX18 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDHAF2Q9NX18 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDHAF2Q9NX18 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDHAF2Q9NX18 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms