Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWY4

HPF1, Histone PARylation factor 1, humanhuman

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPF1Q9NWY4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPF1Q9NWY4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPF1Q9NWY4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPF1Q9NWY4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPF1Q9NWY4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPF1Q9NWY4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPF1Q9NWY4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPF1Q9NWY4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPF1Q9NWY4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HPF1Q9NWY4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPF1Q9NWY4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPF1Q9NWY4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPF1Q9NWY4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPF1Q9NWY4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPF1Q9NWY4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPF1Q9NWY4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPF1Q9NWY4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPF1Q9NWY4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPF1Q9NWY4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPF1Q9NWY4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPF1Q9NWY4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPF1Q9NWY4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPF1Q9NWY4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPF1Q9NWY4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HPF1Q9NWY4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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