Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNBIP1Q9NSA3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNBIP1Q9NSA3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms