Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUDS3Q9H7L9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SUDS3Q9H7L9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms