Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6A0

DENND2D, DENN domain-containing protein 2D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2DQ9H6A0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND2DQ9H6A0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2DQ9H6A0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND2DQ9H6A0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms