Protein–RNA interactions for Protein: Q9H321

VCX3B, Variable charge X-linked protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3BQ9H321 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VCX3BQ9H321 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms