Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms