Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLIRPQ9GZT3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLIRPQ9GZT3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLIRPQ9GZT3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLIRPQ9GZT3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLIRPQ9GZT3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLIRPQ9GZT3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLIRPQ9GZT3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms