Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC27Q9C0I9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC27Q9C0I9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC27Q9C0I9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC27Q9C0I9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC27Q9C0I9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC27Q9C0I9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC27Q9C0I9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC27Q9C0I9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC27Q9C0I9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC27Q9C0I9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC27Q9C0I9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC27Q9C0I9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC27Q9C0I9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms