Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
BARHL1Q9BZE3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms